SarcopterygiiLink Wikipedia to HumanLink Ensembl
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WARNING: Genomicus is based on data from Ensembl, and the current release of Ensembl (version 94) has reported issues with the construction of phylogenetic trees. This causes large gene families (> ~400 homologs) to be split in several smaller families. Please see http://www.ensembl.info/2018/10/24/changes-to-paralogy-in-release-94.
 
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Sarcopterygii speciation node (click to collapse) Sarcopterygii (~400 My ago) - block_165 Click to show this node (Tetrapoda) Tetrapoda speciation node (click to collapse) Click to show this node (Amniota) Amniota speciation node (click to collapse) Click to show this node (Mammalia) Mammalia speciation node (click to collapse) Click to show this node (Theria) Theria speciation node (click to collapse) Click to show this node (Eutheria) Eutheria speciation node (click to collapse) Click to show this node (Boreoeutheria) Boreoeutheria speciation node (click to collapse) Click to show this node (Euarchontoglires) Euarchontoglires speciation node (click to collapse) Click to show this node (Primates) Primates speciation node (click to collapse) Click to show this node (Haplorrhini) Haplorrhini speciation node (click to collapse) Click to show this node (Simiiformes) Simiiformes speciation node (click to collapse) Click to show this node (Catarrhini) Catarrhini speciation node (click to collapse) Click to show this node (Hominoidea) Hominoidea speciation node (click to collapse) Click to show this node (Hominidae) Hominidae speciation node (click to collapse) Click to show this node (Homo/Pan/Gorilla group) Homo/Pan/Gorilla group speciation node (click to collapse) Click to show this node (Homo/Pan group) Homo/Pan group speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Human) Human terminal node Human - Chr:12 Click to show this node (Pan) Pan speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Chimpanzee) Chimpanzee terminal node Chimpanzee - Chr:12 HOXC8 (ENSPTRG00000005030) HOXC9 (ENSPTRG00000005029) ENSPTRG00000049293 ENSPTRG00000048517 ENSPTRG00000052178 Click to hide this line (pygmy chimpanzee) pygmy chimpanzee terminal node pygmy chimpanzee - Chr:12 HOXC8 (ENSPPAG00000033394) HOXC9 (ENSPPAG00000035907) ENSPPAG00000038939 Click to hide this line (Gorilla) Gorilla terminal node Gorilla - Chr:12 HOXC8 (ENSGGOG00000006289) HOXC9 (ENSGGOG00000006282) ENSGGOG00000024256 Click to hide this line (Orangutan) Orangutan terminal node Orangutan - Chr:12 ENSPPYG00000004564 TNS2 (ENSPPYG00000004565) ENSPPYG00000025849 HOXC9 (ENSPPYG00000004592) HOXC8 (ENSPPYG00000004593) Click to hide this line (Gibbon) Gibbon terminal node Gibbon - Chr:11 HOXC8 (ENSNLEG00000017677) HOXC9 (ENSNLEG00000017678) ENSNLEG00000029784 Click to show this node (Cercopithecidae) Cercopithecidae speciation node (click to collapse) Click to show this node (Cercopithecinae) Cercopithecinae speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Drill) Drill terminal node Drill - Chr:KN976403.1 HOXC9 (ENSMLEG00000033394) HOXC8 (ENSMLEG00000001814) HOXC4 (ENSMLEG00000001957) Click to hide this line (Olive baboon) Olive baboon terminal node Olive baboon - Chr:11 TNS2 (ENSPANG00000014073) ENSPANG00000035744 HOXC9 (ENSPANG00000014167) Click to show this node (Macaca) Macaca speciation node (click to collapse) Click to show this node (Rhesus) Click to show this node (Rhesus) Click to hide this line (Crab-eating macaque) Crab-eating macaque terminal node Crab-eating macaque - Chr:11 TNS2 (ENSMFAG00000032151) ENSMFAG00000043577 HOXC9 (ENSMFAG00000042260) HOXC8 (ENSMFAG00000002443) Click to hide this line (Pig-tailed macaque) Pig-tailed macaque terminal node Pig-tailed macaque - Chr:KQ009005.1 HOXC8 (ENSMNEG00000039027) HOXC9 (ENSMNEG00000036510) ENSMNEG00000028594 TNS2 (ENSMNEG00000031140) Click to hide this line (Sooty mangabey) Sooty mangabey terminal node Sooty mangabey - Chr:KQ012553.1 SMUG1 (ENSCATG00000042299) HOXC4 (ENSCATG00000036624) HOXC8 (ENSCATG00000043163) TNS2 (ENSCATG00000039493) Click to hide this line (Vervet Monkey) Vervet Monkey terminal node Vervet Monkey - Chr:11 TNS2 (ENSCSAG00000005561) HOXC9 (ENSCSAG00000005453) HOXC8 (ENSCSAG00000005451) Click to show this node (Colobinae) Colobinae speciation node (click to collapse) Click to show this node (Rhinopithecus) Click to show this node (Rhinopithecus) Click to hide this line (Angola colobus) Angola colobus terminal node Angola colobus - Chr:KN985844.1 HOXC8 (ENSCANG00000037939) HOXC9 (ENSCANG00000014187) ENSCANG00000028515 TNS2 (ENSCANG00000029685) Click to show this node (Platyrrhini) Platyrrhini speciation node (click to collapse) Click to show this node (Cebidae) Cebidae speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Capuchin) Capuchin terminal node Capuchin - Chr:KV389711.1 ENSCCAG00000020775 ENSCCAG00000036221 HOXC9 (ENSCCAG00000004390) HOXC8 (ENSCCAG00000035957) Click to hide this line (Bolivian squirrel monkey) Bolivian squirrel monkey terminal node Bolivian squirrel monkey - Chr:JH378216.1 TNS2 (ENSSBOG00000031927) ENSSBOG00000012565 HOXC9 (ENSSBOG00000027042) HOXC8 (ENSSBOG00000023828) HOXC4 (ENSSBOG00000029739) Click to hide this line (Marmoset) Marmoset terminal node Marmoset - Chr:NTIC01000002.1 ENSCJAG00000042718 ENSCJAG00000041364 ENSCJAG00000039433 HOXC9 (ENSCJAG00000018819) HOXC8 (ENSCJAG00000018828) Click to hide this line (Mas night monkey) Mas night monkey terminal node Mas night monkey - Chr:KZ204462.1 ENSANAG00000036915 ENSANAG00000026581 ENSANAG00000011194 HOXC4 (ENSANAG00000033194) ENSANAG00000036543 ENSANAG00000020854 Click to show this node (Tarsier) Click to show this node (Tarsier) Click to show this node (Strepsirrhini) Strepsirrhini speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Bushbaby) Bushbaby terminal node Bushbaby - Chr:GL873562.1 TNS2 (ENSOGAG00000012472) HOXC9 (ENSOGAG00000003616) HOXC8 (ENSOGAG00000003619) HOXC4 (ENSOGAG00000033004) Click to show this node (Lemuriformes) Lemuriformes speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Mouse lemur) Mouse lemur terminal node Mouse lemur - Chr:7 HOXC8 (ENSMICG00000046543) HOXC9 (ENSMICG00000011714) ENSMICG00000045673 ENSMICG00000042073 Click to hide this line (Coquerels sifaka) Coquerels sifaka terminal node Coquerels sifaka - Chr:KQ014211.1 TNS2 (ENSPCOG00000027013) HOXC9 (ENSPCOG00000027236) HOXC8 (ENSPCOG00000014957) Click to show this node (Glires) Glires speciation node (click to collapse) Click to show this node (Rodentia) Rodentia speciation node (click to collapse) Click to show this node (Hystricognathi) Hystricognathi speciation node (click to collapse) Click to show this node (Hystricomorpha) Hystricomorpha speciation node (click to collapse) Click to show this node (Hystricomorpha_A) Hystricomorpha_A speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Long-tailed chinchilla) Long-tailed chinchilla terminal node Long-tailed chinchilla - Chr:JH721918.1 TNS2 (ENSCLAG00000009285) ENSCLAG00000011497 HOXC9 (ENSCLAG00000008460) ENSCLAG00000008936 Click to hide this line (Degu) Degu terminal node Degu - Chr:JH651608.1 TNS2 (ENSODEG00000014711) ENSODEG00000012995 ENSODEG00000013431 ENSODEG00000020085 HOXC9 (ENSODEG00000013150) HOXC8 (ENSODEG00000014014) Click to show this node (Cavia) Cavia speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Guinea pig) Guinea pig terminal node Guinea pig - Chr:DS562864.1 HOXC8 (ENSCPOG00000039628) ENSCPOG00000038171 ENSCPOG00000033904 ENSCPOG00000032672 ENSCPOG00000030885 TNS2 (ENSCPOG00000024457) ENSCPOG00000005595 Click to show this node (Brazilian-Guinea pig) Click to show this node (Brazilian-Guinea pig) Click to show this node (Bathyergidae) Bathyergidae speciation node (click to collapse) Click to show this node (Heterocephalus glaber) Heterocephalus glaber speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Naked mole-rat female) Naked mole-rat female terminal node Naked mole-rat female - Chr:JH602217.1 ENSHGLG00000002439 ENSHGLG00000001665 ENSHGLG00000019973 HOXC9 (ENSHGLG00000002316) HOXC8 (ENSHGLG00000002335) Click to show this node (Naked mole-rat male) Click to show this node (Naked mole-rat male) Click to hide this line (Damara mole rat) Damara mole rat terminal node Damara mole rat - Chr:KN124398.1 TNS2 (ENSFDAG00000012300) ENSFDAG00000013620 ENSFDAG00000009187 HOXC9 (ENSFDAG00000001749) HOXC8 (ENSFDAG00000016844) Click to show this node (Sciurognathi) Sciurognathi speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Squirrel) Squirrel terminal node Squirrel - Chr:JH393322.1 TNS2 (ENSSTOG00000011007) ENSSTOG00000025374 ENSSTOG00000008217 HOXC9 (ENSSTOG00000012548) HOXC8 (ENSSTOG00000012551) Click to show this node (Myomorpha) Myomorpha speciation node (click to collapse) Click to show this node (Muroidea) Muroidea speciation node (click to collapse) Click to show this node (Cricetidae) Cricetidae speciation node (click to collapse) Click to show this node (Cricetinae) Cricetinae speciation node (click to collapse) Click to show this node (Cricetulus griseus) Cricetulus griseus speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Chinese hamster CHOK1GS) Chinese hamster CHOK1GS terminal node Chinese hamster CHOK1GS - scaffold_0 ENSCGRG00001011981 Prr13 (ENSCGRG00001016470) Gm10337 (ENSCGRG00001010232) ENSCGRG00001015358 ENSCGRG00001017197 Hoxc9 (ENSCGRG00001013912) Click to show this node (Chinese hamster Crigri) Click to show this node (Chinese hamster Crigri) Click to show this node (Cricetidae_B) Cricetidae_B speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Northern American deer mouse) Northern American deer mouse terminal node Northern American deer mouse - Chr:KI615487.1 Hoxc8 (ENSPEMG00000015640) Hoxc9 (ENSPEMG00000011952) ENSPEMG00000017690 ENSPEMG00000008755 Prr13 (ENSPEMG00000017327) Tns2 (ENSPEMG00000002537) Click to hide this line (Prairie vole) Prairie vole terminal node Prairie vole - Chr:15 Hoxc8 (ENSMOCG00000016249) Hoxc9 (ENSMOCG00000019623) Atp5g2 (ENSMOCG00000012641) Prr13 (ENSMOCG00000014216) Tns2 (ENSMOCG00000018864) Click to show this node (Murinae) Murinae speciation node (click to collapse) Click to show this node (Mus) Mus speciation node (click to collapse) Click to show this node (Mus_A) Mus_A speciation node (click to collapse) Click to show this node (Mus_B) Mus_B speciation node (click to collapse) Click to hide this line (spretus) spretus terminal node spretus - Chr:15 MGP_SPRETEiJ_G0021229 MGP_SPRETEiJ_G0021245 MGP_SPRETEiJ_G0021248 MGP_SPRETEiJ_G0021253 Click to hide this line (Mouse) Mouse terminal node Mouse - Chr:15 Prr13 (ENSMUSG00000023048) Gm10337 (ENSMUSG00000071586) Atp5g2 (ENSMUSG00000062683) Click to hide this line (Ryukyu mouse) Ryukyu mouse terminal node Ryukyu mouse - Chr:15 Tns2 (MGP_CAROLIEiJ_G0020336) Prr13 (MGP_CAROLIEiJ_G0020352) MGP_CAROLIEiJ_G0020354 Gm10337 (MGP_CAROLIEiJ_G0020355) Atp5g2 (MGP_CAROLIEiJ_G0020360) Click to hide this line (Shrew mouse) Shrew mouse terminal node Shrew mouse - Chr:17 Tns2 (MGP_PahariEiJ_G0020335) Prr13 (MGP_PahariEiJ_G0020351) Gm10337 (MGP_PahariEiJ_G0020354) Atp5g2 (MGP_PahariEiJ_G0020359) Click to hide this line (Rat) Rat terminal node Rat - Chr:7 Prr13 (ENSRNOG00000042094) Atp5mc2 (ENSRNOG00000015320) AABR07058934.1 (ENSRNOG00000016100) Hoxc9 (ENSRNOG00000016199) Hoxc8 (ENSRNOG00000028619) Click to hide this line (Upper Galilee mountains blind mole rat) Upper Galilee mountains blind mole rat terminal node Upper Galilee mountains blind mole rat - Chr:KL198929.1 ENSNGAG00000006649 Prr13 (ENSNGAG00000007574) ENSNGAG00000016268 ENSNGAG00000020790 Hoxc9 (ENSNGAG00000012023) Hoxc8 (ENSNGAG00000012817) Click to hide this line (Lesser Egyptian jerboa) Lesser Egyptian jerboa terminal node Lesser Egyptian jerboa - Chr:JH725438.1 Tns2 (ENSJJAG00000010755) Gm10337 (ENSJJAG00000003834) ENSJJAG00000012378 Atp5g2 (ENSJJAG00000009417) Hoxc9 (ENSJJAG00000020953) Click to hide this line (Kangaroo rat) Kangaroo rat terminal node Kangaroo rat - Chr:KN672501.1 Tns2 (ENSDORG00000015042) ENSDORG00000024095 Atp5g2 (ENSDORG00000002955) Hoxc9 (ENSDORG00000028578) Hoxc8 (ENSDORG00000023838) Hoxc4 (ENSDORG00000007001) Click to show this node (Lagomorpha) Lagomorpha speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Rabbit) Rabbit terminal node Rabbit - Chr:4 ENSOCUG00000004445 ENSOCUG00000022568 HOXC9 (ENSOCUG00000001160) HOXC8 (ENSOCUG00000004741) HOXC4 (ENSOCUG00000015516) Click to show this node (Pika) Click to show this node (Pika) Click to show this node (Laurasiatheria) Laurasiatheria speciation node (click to collapse) Click to show this node (Cetartiodactyla) Cetartiodactyla speciation node (click to collapse) Click to show this node (Bovidae) Bovidae speciation node (click to collapse) Click to show this node (Caprinae) Caprinae speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Sheep) Sheep terminal node Sheep - Chr:3 HOXC8 (ENSOARG00000016306) HOXC9 (ENSOARG00000016319) TNS2 (ENSOARG00000016737) EIF4B (ENSOARG00000016759) Click to hide this line (Goat) Goat terminal node Goat - Chr:5 ENSCHIG00000009554 ENSCHIG00000022160 ENSCHIG00000025106 TNS2 (ENSCHIG00000005570) ENSCHIG00000012380 Click to hide this line (Cow) Cow terminal node Cow - Chr:5 HOXC8 (ENSBTAG00000012149) HOXC9 (ENSBTAG00000005606) TNS2 (ENSBTAG00000006904) Click to show this node (Dolphin) Click to show this node (Dolphin) Click to hide this line (Pig) Pig terminal node Pig - Chr:5 ENSSSCG00000032028 TNS2 (ENSSSCG00000000263) ENSSSCG00000040262 HOXC9 (ENSSSCG00000034474) HOXC8 (ENSSSCG00000038644) Click to show this node (Chiroptera) Chiroptera speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Microbat) Microbat terminal node Microbat - Chr:GL429927 EIF4B (ENSMLUG00000013021) TNS2 (ENSMLUG00000013033) HOXC9 (ENSMLUG00000000483) HOXC8 (ENSMLUG00000003097) Click to show this node (Megabat) Click to show this node (Megabat) Click to hide this line (Horse) Horse terminal node Horse - Chr:6 TNS2 (ENSECAG00000010909) ENSECAG00000000825 HOXC9 (ENSECAG00000000726) ENSECAG00000000932 Click to show this node (Insectivora) Click to show this node (Insectivora) Click to show this node (Carnivora) Carnivora speciation node (click to collapse) Click to show this node (Caniformia) Caniformia speciation node (click to collapse) Click to show this node (Caniformia_b) Caniformia_b speciation node (click to collapse) Click to show this node (Giant Panda) Click to show this node (Giant Panda) Click to hide this line (Ferret) Ferret terminal node Ferret - Chr:GL897098.1 HOXC8 (ENSMPUG00000005854) HOXC9 (ENSMPUG00000005862) ENSMPUG00000005897 ENSMPUG00000005927 TNS2 (ENSMPUG00000006189) Click to hide this line (Dog) Dog terminal node Dog - Chr:27 ENSCAFG00000032625 ENSCAFG00000028801 ENSCAFG00000006653 ENSCAFG00000030359 ENSCAFG00000028560 ENSCAFG00000030325 Click to show this node (Felidae) Felidae speciation node (click to collapse) Click to show this node (Panthera) Panthera speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Tiger) Tiger terminal node Tiger - Chr:KE721754.1 ENSPTIG00000012759 HOXC9 (ENSPTIG00000013688) HOXC8 (ENSPTIG00000013899) Click to hide this line (leopard) leopard terminal node leopard - Chr:KV860349.1 ENSPPRG00000019762 HOXC9 (ENSPPRG00000015964) Click to hide this line (Cat) Cat terminal node Cat - Chr:B4 ENSFCAG00000027105 HOXC9 (ENSFCAG00000031037) HOXC8 (ENSFCAG00000004769) Click to show this node (Atlantogenata) Atlantogenata speciation node (click to collapse) Click to show this node (Afrotheria) Afrotheria speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Elephant) Elephant terminal node Elephant - scaffold_2 TNS2 (ENSLAFG00000009544) ENSLAFG00000013184 ENSLAFG00000029818 ENSLAFG00000015528 HOXC9 (ENSLAFG00000002366) HOXC8 (ENSLAFG00000018140) Click to show this node (Hyrax) Click to show this node (Hyrax) Click to show this node (Tenrec) Click to show this node (Tenrec) Click to show this node (Xenarthra) Click to show this node (Xenarthra) Click to show this node (Marsupialia) Click to show this node (Marsupialia) Click to show this node (Sauria) Click to show this node (Sauria) Click to show this node (Frog) Click to show this node (Frog) Click to show this node (Coelacanth) Click to show this node (Coelacanth) ENSGT00940000159006 AC012531.2 (ENSG00000273049) HOXC6 (ENSG00000197757) HOXC10 (ENSG00000180818) HOXC11 (ENSG00000123388) HOXC12 (ENSG00000123407) HOXC13 (ENSG00000123364) CALCOCO1 (ENSG00000012822) ATP5MC2 (ENSG00000135390) ATF7 (ENSG00000170653) AC023509.3 (ENSG00000267281) NPFF (ENSG00000139574) TARBP2 (ENSG00000139546) MAP3K12 (ENSG00000139625) PCBP2 (ENSG00000197111) PRR13 (ENSG00000205352) AMHR2 (ENSG00000135409) SP1 (ENSG00000185591) SP7 (ENSG00000170374) AAAS (ENSG00000094914) C12orf10 (ENSG00000139637) PFDN5 (ENSG00000123349) ESPL1 (ENSG00000135476) MFSD5 (ENSG00000182544) AC021072.1 (ENSG00000283536) RARG (ENSG00000172819) ITGB7 (ENSG00000139626) ZNF740 (ENSG00000139651) CSAD (ENSG00000139631) SOAT2 (ENSG00000167780) IGFBP6 (ENSG00000167779) SPRYD3 (ENSG00000167778) SOAT2 (ENSPTRG00000005002) CSAD (ENSPTRG00000005004) ZNF740 (ENSPTRG00000005005) ITGB7 (ENSPTRG00000005006) RARG (ENSPTRG00000005007) ENSPTRG00000050981 MFSD5 (ENSPTRG00000005008) ESPL1 (ENSPTRG00000005009) PFDN5 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