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Vertebrata speciation node (click to collapse) Vertebrata (~550 My ago) Click to show this node (Euteleostomi) Euteleostomi speciation node (click to collapse) Click to show this node (Sarcopterygii) Sarcopterygii speciation node (click to collapse) Click to show this node (Tetrapoda) Tetrapoda speciation node (click to collapse) Click to show this node (Amniota) Amniota speciation node (click to collapse) Click to show this node (Mammalia) Mammalia speciation node (click to collapse) Click to show this node (Theria) Theria speciation node (click to collapse) Click to show this node (Eutheria) Eutheria speciation node (click to collapse) Click to show this node (Boreoeutheria) Boreoeutheria speciation node (click to collapse) Click to show this node (Euarchontoglires) Euarchontoglires speciation node (click to collapse) Click to show this node (Primates) Primates speciation node (click to collapse) Click to show this node (Haplorrhini) Haplorrhini speciation node (click to collapse) Click to show this node (Simiiformes) Simiiformes speciation node (click to collapse) Click to show this node (Catarrhini) Catarrhini speciation node (click to collapse) Click to show this node (Hominoidea) Hominoidea speciation node (click to collapse) Click to show this node (Hominidae) Hominidae speciation node (click to collapse) Click to show this node (Homo/Pan/Gorilla group) Homo/Pan/Gorilla group speciation node (click to collapse) Click to show this node (Homo/Pan group) Homo/Pan group speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Human) Human terminal node Human - Chr:12 Click to hide this line (Chimpanzee) Chimpanzee terminal node Chimpanzee - Chr:12 ATP5G2 (ENSPTRG00000005023) Click to hide this line (Gorilla) Gorilla terminal node Gorilla - Chr:12 ATP5G2 (ENSGGOG00000015641) Click to hide this line (Orangutan) Orangutan terminal node Orangutan - Chr:12 RARG (ENSPPYG00000004572) ENSPPYG00000025849 ATP5G2 (ENSPPYG00000004586) Click to hide this line (Gibbon) Gibbon terminal node Gibbon - Chr:GL397261.1 ATP5G2 (ENSNLEG00000017686) Click to show this node (Cercopithecinae) Cercopithecinae speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Vervet Monkey) Vervet Monkey terminal node Vervet Monkey - Chr:11 ATP5G2 (ENSCSAG00000005468) Click to hide this line (Rhesus) Rhesus terminal node Rhesus - Chr:11 ATP5G2 (ENSMMUG00000016241) CALCOCO1 (ENSMMUG00000009457) Click to hide this line (Olive baboon) Olive baboon terminal node Olive baboon - Chr:11 ENSPANG00000014072 CALCOCO1 (ENSPANG00000011373) Click to hide this line (Marmoset) Marmoset terminal node Marmoset - Chr:9 ENSCJAG00000022573 ENSCJAG00000031917 ENSCJAG00000034694 Click to show this node (Tarsier) Click to show this node (Tarsier) Click to show this node (Strepsirrhini) Strepsirrhini speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Bushbaby) Bushbaby terminal node Bushbaby - Chr:GL873562.1 ENSOGAG00000003611 CALCOCO1 (ENSOGAG00000003612) HOXC13 (ENSOGAG00000030391) Click to hide this line (Mouse lemur) Mouse lemur terminal node Mouse lemur - Chr:KQ052969.1 ATP5G2 (ENSMICG00000011686) CALCOCO1 (ENSMICG00000011694) HOXC12 (ENSMICG00000011709) Click to show this node (Glires) Glires speciation node (click to collapse) Click to show this node (Rodentia) Rodentia speciation node (click to collapse) Click to show this node (Sciurognathi) Sciurognathi speciation node (click to collapse) Click to show this node (Murinae) Murinae speciation node (click to collapse) Click to show this node (Mus) Mus speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Mouse) Mouse terminal node Mouse - Chr:15 Prr13 (ENSMUSG00000023048) Gm10337 (ENSMUSG00000071586) Click to hide this line (spretus) spretus terminal node spretus - Chr:15 MGP_SPRETEiJ_G0021245 MGP_SPRETEiJ_G0021248 Click to hide this line (Rat) Rat terminal node Rat - Chr:7 Prr13 (ENSRNOG00000042094) Atp5g2 (ENSRNOG00000015320) Click to show this node (Kangaroo rat) Click to show this node (Kangaroo rat) Click to hide this line (Squirrel) Squirrel terminal node Squirrel - Chr:JH393322.1 ENSSTOG00000003624 ENSSTOG00000025374 ATP5G2 (ENSSTOG00000008217) Click to hide this line (Guinea pig) Guinea pig terminal node Guinea pig - scaffold_9 ATP5G2 (ENSCPOG00000022889) ENSCPOG00000026671 Click to show this node (Lagomorpha) Lagomorpha speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Rabbit) Rabbit terminal node Rabbit - Chr:4 HOXC13 (ENSOCUG00000001156) ENSOCUG00000022568 Click to show this node (Pika) Click to show this node (Pika) Click to show this node (Laurasiatheria) Laurasiatheria speciation node (click to collapse) Click to show this node (Chiroptera) Chiroptera speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Microbat) Microbat terminal node Microbat - Chr:GL429927 RARG (ENSMLUG00000017284) ENSMLUG00000011860 CALCOCO1 (ENSMLUG00000011866) Click to show this node (Megabat) Click to show this node (Megabat) Click to show this node (Insectivora) Click to show this node (Insectivora) Click to hide this line (Horse) Horse terminal node Horse - Chr:6 ENSECAG00000000825 ATP5G2 (ENSECAG00000023021) Click to show this node (Carnivora) Carnivora speciation node (click to collapse) Click to show this node (Caniformia) Caniformia speciation node (click to collapse) Click to show this node (Caniformia_b) Caniformia_b speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Giant Panda) Giant Panda terminal node Giant Panda - Chr:GL193014.1 ENSAMEG00000019382 Click to hide this line (Ferret) Ferret terminal node Ferret - Chr:GL897098.1 CALCOCO1 (ENSMPUG00000005917) ENSMPUG00000005927 Click to hide this line (Dog) Dog terminal node Dog - Chr:27 ENSCAFG00000030359 ENSCAFG00000028560 ENSCAFG00000006927 ENSCAFG00000030325 Click to hide this line (Cat) Cat terminal node Cat - Chr:B4 ATP5G2 (ENSFCAG00000001502) Click to show this node (Cetartiodactyla) Cetartiodactyla speciation node (click to collapse) Click to show this node (Bovidae) Bovidae speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Cow) Cow terminal node Cow - Chr:5 ATP5G2 (ENSBTAG00000005735) Click to hide this line (Sheep) Sheep terminal node Sheep - Chr:3 ATP5G2 (ENSOARG00000016393) RARG (ENSOARG00000016626) Click to show this node (Dolphin) Click to show this node (Dolphin) Click to hide this line (Pig) Pig terminal node Pig - Chr:5 ENSSSCG00000026548 Click to show this node (Atlantogenata) Atlantogenata speciation node (click to collapse) Click to show this node (Afrotheria) Afrotheria speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Elephant) Elephant terminal node Elephant - scaffold_2 ENSLAFG00000013184 ENSLAFG00000029818 ATP5G2 (ENSLAFG00000015528) Click to show this node (Hyrax) Click to show this node (Hyrax) Click to show this node (Tenrec) Click to show this node (Tenrec) Click to show this node (Xenarthra) Xenarthra speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Armadillo) Armadillo terminal node Armadillo - Chr:JH569826.1 ENSDNOG00000042952 ATP5G2 (ENSDNOG00000009429) CALCOCO1 (ENSDNOG00000032227) Click to show this node (Marsupialia) Marsupialia speciation node (click to collapse) Click to show this node (Diprotodontia) Diprotodontia speciation node (click to collapse) Click to show this node (Wallaby) Click to show this node (Wallaby) Click to hide this line (Tasmanian harrisii) Tasmanian harrisii terminal node Tasmanian harrisii - Chr:GL862091.1 Click to show this node (Sauria) Click to show this node (Sauria) Click to hide this line (Frog) Frog terminal node Frog - Chr:GL172862.1 hoxc4 (ENSXETG00000023484) hoxc3 (ENSXETG00000025181) ENSXETG00000033648 ENSXETG00000033674 ENSXETG00000025180 Click to hide this line (Coelacanth) Coelacanth terminal node Coelacanth - Chr:JH126659.1 si:dkey-90a13.10 (ENSLACG00000022415) CCNT1 (ENSLACG00000017559) RNF41 (ENSLACG00000017605) SMARCC2 (ENSLACG00000017661) zgc:153867 (ENSLACG00000017747) ESYT1 (ENSLACG00000017835) MARCH9 (ENSLACG00000017934) Click to show this node (Neopterygii) Neopterygii speciation node (click to collapse) Click to show this node (Clupeocephala) Clupeocephala speciation node (click to collapse) Click to show this node (Acanthomorphata) Acanthomorphata speciation node (click to collapse) Click to show this node (Percomorphaceae) Percomorphaceae speciation node (click to collapse) Click to show this node (Eupercaria) Eupercaria speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Stickleback) Stickleback terminal node Stickleback - Chr:groupXVII ENSGACG00000006631 igsf8 (ENSGACG00000006633) ENSGACG00000006655 ENSGACG00000006657 ENSGACG00000006676 ENSGACG00000006817 col2a1b (ENSGACG00000006819) NCKAP1L (ENSGACG00000006854) Click to show this node (Tetraodontidae) Tetraodontidae speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Fugu) Fugu terminal node Fugu - scaffold_33 tgm5l (ENSTRUG00000013631) eya2 (ENSTRUG00000013676) rtfdc1 (ENSTRUG00000013750) gcnt7 (ENSTRUG00000013825) tfap2c (ENSTRUG00000013876) CDH22 (ENSTRUG00000013921) znfx1 (ENSTRUG00000014181) ENSTRUG00000014282 ENSTRUG00000014367 igsf8 (ENSTRUG00000014424) soat2 (ENSTRUG00000014440) Click to show this node (Ovalentaria) Ovalentaria speciation node (click to collapse) Click to show this node (Atherinomorphae) Atherinomorphae speciation node (click to collapse) Click to show this node (Poeciliinae) Poeciliinae speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Amazon molly) Amazon molly terminal node Amazon molly - Chr:KI519700.1 GGT7 (ENSPFOG00000008502) TP53INP2 (ENSPFOG00000008642) snai1b (ENSPFOG00000008667) ENSPFOG00000023291 ENSPFOG00000023332 samhd1 (ENSPFOG00000008702) ENSPFOG00000009064 KBTBD12 (1 of many) (ENSPFOG00000009220) SLC26A6 (1 of many) (ENSPFOG00000009341) si:ch211-117c9.5 (ENSPFOG00000009646) zgc:158254 (ENSPFOG00000024359) ENSPFOG00000009916 ENSPFOG00000010009 ENSPFOG00000010462 Click to hide this line (Platyfish) Platyfish terminal node Platyfish - Chr:JH557020.1 ENSXMAG00000007436 samhd1 (ENSXMAG00000007439) ENSXMAG00000007457 KBTBD12 (1 of many) (ENSXMAG00000007470) SLC26A6 (1 of many) (ENSXMAG00000007476) si:ch211-117c9.5 (ENSXMAG00000007523) zgc:158254 (ENSXMAG00000007547) ENSXMAG00000007548 ENSXMAG00000007551 ddx20 (ENSXMAG00000007573) Click to hide this line (Medaka) Medaka terminal node Medaka - Chr:7 ddx20 (ENSORLG00000008949) cdk16 (ENSORLG00000009019) zgc:158254 (ENSORLG00000009038) ENSORLG00000009063 si:ch211-117c9.5 (ENSORLG00000009110) SLC26A6 (1 of many) (ENSORLG00000009169) KBTBD12 (1 of many) (ENSORLG00000009182) samhd1 (ENSORLG00000009232) snai1b (ENSORLG00000009246) ggt7 (ENSORLG00000009271) ncoa6 (ENSORLG00000009292) top1 (ENSORLG00000009314) plcg1 (ENSORLG00000009380) zhx3 (ENSORLG00000009397) Click to hide this line (Tilapia) Tilapia terminal node Tilapia - Chr:GL831196.1 ENSONIG00000012438 ENSONIG00000012440 zgc:158254 (ENSONIG00000012447) ENSONIG00000012448 si:ch211-117c9.5 (ENSONIG00000012449) SLC26A6 (1 of many) (ENSONIG00000012458) KBTBD12 (1 of many) (ENSONIG00000012463) ENSONIG00000012465 si:ch73-236c18.8 (ENSONIG00000012466) Click to show this node (Atlantic cod) Click to show this node (Atlantic cod) Click to show this node (Otophysi) Otophysi speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Cave fish) Cave fish terminal node Cave fish - Chr:KB882116.1 ENSAMXG00000024716 ENSAMXG00000024717 lrp1aa (ENSAMXG00000024718) ENSAMXG00000025045 ENSAMXG00000024719 ENSAMXG00000024720 ENSAMXG00000024721 ENSAMXG00000024723 ndrg3a (ENSAMXG00000024724) phf20a (ENSAMXG00000024725) zgc:92107 (ENSAMXG00000024726) SULF2 (1 of many) (ENSAMXG00000024727) timm17a (ENSAMXG00000024728) lmod1b (ENSAMXG00000024729) Click to hide this line (Spotted gar) Spotted gar terminal node Spotted gar - Chr:LG4 eif4ba (ENSLOCG00000005500) tns2a (ENSLOCG00000005524) ENSLOCG00000018202 ENSLOCG00000005638 ENSLOCG00000005658 ENSLOCG00000018204 ENSLOCG00000005691 tespa1 (ENSLOCG00000005735) ATF7 (ENSG00000170653) RP11-793H13.10 (ENSG00000267281) NPFF (ENSG00000139574) TARBP2 (ENSG00000139546) MAP3K12 (ENSG00000139625) PCBP2 (ENSG00000197111) PRR13 (ENSG00000205352) AMHR2 (ENSG00000135409) SP1 (ENSG00000185591) SP7 (ENSG00000170374) AAAS (ENSG00000094914) C12orf10 (ENSG00000139637) PFDN5 (ENSG00000123349) ESPL1 (ENSG00000135476) MFSD5 (ENSG00000182544) MFSD5 (ENSPTRG00000005008) ESPL1 (ENSPTRG00000005009) PFDN5 (ENSPTRG00000005010) C12H12orf10 (ENSPTRG00000005011) AAAS (ENSPTRG00000005012) SP7 (ENSPTRG00000005013) SP1 (ENSPTRG00000005014) AMHR2 (ENSPTRG00000005015) PRR13 (ENSPTRG00000029739) PCBP2 (ENSPTRG00000005018) MAP3K12 (ENSPTRG00000005019) TARBP2 (ENSPTRG00000005020) NPFF (ENSPTRG00000005021) ATF7 (ENSPTRG00000005022) ATF7 (ENSGGOG00000015195) NPFF (ENSGGOG00000012647) TARBP2 (ENSGGOG00000012637) MAP3K12 (ENSGGOG00000012622) ENSGGOG00000012613 PRR13 (ENSGGOG00000012608) AMHR2 (ENSGGOG00000012599) SP1 (ENSGGOG00000012593) SP7 (ENSGGOG00000015818) AAAS (ENSGGOG00000015799) C12orf10 (ENSGGOG00000015795) PFDN5 (ENSGGOG00000026308) ESPL1 (ENSGGOG00000001600) MFSD5 (ENSGGOG00000004121) ATF7 (ENSPPYG00000004585) NPFF (ENSPPYG00000004584) TARBP2 (ENSPPYG00000004583) MAP3K12 (ENSPPYG00000004582) PCBP2 (ENSPPYG00000004581) AMHR2 (ENSPPYG00000004580) SP1 (ENSPPYG00000004579) AAAS (ENSPPYG00000004577) C12orf10 (ENSPPYG00000004576) PFDN5 (ENSPPYG00000004575) ESPL1 (ENSPPYG00000004574) MFSD5 (ENSPPYG00000004573) MFSD5 (ENSNLEG00000017713) ESPL1 (ENSNLEG00000017709) PFDN5 (ENSNLEG00000017706) C12orf10 (ENSNLEG00000017704) AAAS (ENSNLEG00000017702) SP7 (ENSNLEG00000017701) SP1 (ENSNLEG00000017699) AMHR2 (ENSNLEG00000017698) PRR13 (ENSNLEG00000017697) ENSNLEG00000017693 MAP3K12 (ENSNLEG00000017692) TARBP2 (ENSNLEG00000017690) NPFF (ENSNLEG00000017689) ENSNLEG00000017688 ATF7 (ENSCSAG00000005473) NPFF (ENSCSAG00000005475) TARBP2 (ENSCSAG00000005479) MAP3K12 (ENSCSAG00000005483) PCBP2 (ENSCSAG00000005487) PRR13 (ENSCSAG00000005490) AMHR2 (ENSCSAG00000005495) SP1 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